He puesto el sqlInitizalize antes del sqlBackup.

workflow.R

@@ -3,12 +3,12 @@ source("sqlFunctions.R")
 ## Asegurarse de que la variable file sea la que nos corresponde:
 file
 
-# Crear copia de seguridad
-sqlBackUp(bu.dir="BU_OVARIO")
-
 # Cargar dependencias
 sqlInitialize()
 
+# Crear copia de seguridad
+sqlBackUp(bu.dir="BU_OVARIO")
+
 # Inicializar conexión
 dta<-odbcConnectAccess2007(access.file = file, 
                            pwd = .rs.askForPassword("Enter password:"))