Scripts relacionados con el acceso y análisis en bases de datos Access.
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source("sqlFunctions.R", encoding = "UTF-8")
# Cargar dependencias
sqlInitialize()
## Asegurarse de que la variable file sea la que nos corresponde:
file
# Crear copia de seguridad
sqlBackUp()
# Inicializar conexión
dta<-odbcConnectAccess2007(access.file = file,
pwd = .rs.askForPassword("Enter password:"))
## Importamos los NHC de las muestras nuevas
nhc.test<-read.xlsx("queryOV.xlsx", sheet = "NHC") %>% pull(NHC)
# Ver si ya hay muestras de los pacientes (opcional, para uno mismo)
sqlShowSamples()
# Generar código OVID para muestras nuevas
sqlGenOVID(sinc=T)
# Rellenar fichero plantilla "QueryOV.xlsx"
sqlWriteTemp()
####
# Rellenar la plantilla con la información de la muestra y/o la información clínica del paciente
####
# Sincronizar lo rellenado en las pestañas samples y clinics
sqlSincBD(sinc.samples = T, sinc.clinics = T)