invivo

InVivo-hdc.Rmd

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 title: "InVivo Hojas de Cálculo"
 date: "November 17, 2020"
 output: html_document
+css: "style.css"
 ---
 
 ```{r setup, include=FALSE}
 knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
 ```
 
+Esta documentación sirve para entender los requisitos de la aplicación **in vivo**. Las hojas de cálculo requieren algunas columnas concretas y algunas hojas que tienen que estar presente para su correcto funcionamiento.
+
+## Asignación aleatoria de grupos basada en tamaño de tumor
+
+La hoja de excel que le entremos a la pestaña *Diseño* de la aplicación *in vivo* debe contener dos hojas (el nombre de las hojas no importa).
+
+1. Una con dos columnas llamadas: "MouseID" y "Volumen".
+
+![](imagenes/invivo1.png)
+
+2. Otra hoja con una columna llamada "Groups" y a continuación el nombre de los grupos que queramos asignar.
+
+![](imagenes/invivo2.png)
+
+---
+
+## Hoja de seguimiento del *in vivo*
+
+### Análisis de respuesta (sin vacunación)
+
+Para este formato se requieren las siguientes columnas (el orden no es importante):
+
+- "ID": define la identidad del tumor.
+- "Group": define el grupo de tratamiento.
+- "DPV" o "TS" (Opcional): si no contiene alguna de esas columnas, el programa interpretará que los valores son el volumen directamente (como la imagen de ejemplo).
+
+![](imagenes/invivo3.png)
+
+### Análisis de respuesta de vacunación
+
+Para este formato se requieren las siguientes columnas (el orden no es importante):
+
+- "ID animal": define la identidad del ratón.
+- "ID tumor": define el lado del tumor ("R" o "L"). Por ahora, el programa entiende que el lado de vacunación es el derecho (R).
+- "Group": define el grupo de tratamiento.
+- "DPV" o "TS" (Opcional): si no contiene alguna de esas columnas, el programa interpretará que los valores son el volumen directamente (como la imagen de ejemplo).
+
+![](imagenes/invivo4.png)
+
+![](imagenes/invivo5.png)

style.css

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+.figure{
+  margin-bottom:2em;
+  }