Browse Source

Corretgir concentració.

Afegir càlcul fmol.
master
Costa 3 years ago
parent
commit
082a9bae3d
1 changed files with 7 additions and 6 deletions
  1. +7
    -6
      app.R

+ 7
- 6
app.R

@ -2,7 +2,7 @@ library(shiny)
library(rhandsontable)
DF<-as.data.frame(matrix(nrow=1, ncol=5))
colnames(DF)<-c("ID","Concentració Vector (ng)","Longitud Vector (bp)","Concentració Insert (ng)","Longitud Insert (bp)")
colnames(DF)<-c("ID","Concentració Vector (ng/ul)","Longitud Vector (bp)","Concentració Insert (ng/ul)","Longitud Insert (bp)")
DF[1,]<-rep("",5)
ui <- fluidPage(
@ -77,7 +77,7 @@ server <- function(input, output) {
t[2:5]<-as.data.frame(t(apply(t[2:5],2,as.numeric)))
}
Vv<-( (input$voltotal*t$`Concentració Insert (ng)`*t$`Longitud Vector (bp)`)/(t$`Concentració Vector (ng)`*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio) ) / (1+(t$`Concentració Insert (ng)`*t$`Longitud Vector (bp)`)/(t$`Concentració Vector (ng)`*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio))
Vv<-( (input$voltotal*t$`Concentració Insert (ng/ul)`*t$`Longitud Vector (bp)`)/(t$`Concentració Vector (ng/ul)`*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio) ) / (1+(t$`Concentració Insert (ng/ul)`*t$`Longitud Vector (bp)`)/(t$`Concentració Vector (ng/ul)`*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio))
Vi<-input$voltotal-Vv
t[,"Volum vector (ul)"]<-Vv
@ -87,19 +87,20 @@ server <- function(input, output) {
Vv.log<-Vv < input$minim
if (TRUE %in% Vv.log){
alt.conc.vect<-( (input$voltotal-input$minim)*t$`Concentració Insert (ng)`*t$`Longitud Vector (bp)`)/ (input$minim*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio)
t$`Dilució vector`[Vv.log]<-(t$`Concentració Vector (ng)`/alt.conc.vect)[Vv.log]
alt.conc.vect<-( (input$voltotal-input$minim)*t$`Concentració Insert (ng/ul)`*t$`Longitud Vector (bp)`)/ (input$minim*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio)
t$`Dilució vector`[Vv.log]<-(t$`Concentració Vector (ng/ul)`/alt.conc.vect)[Vv.log]
t$`Volum vector (ul)`[Vv.log]<-input$minim
t$`Volum insert (ul)`[Vv.log]<-(input$voltotal-input$minim)
}
Vi.log<-Vi < input$minim
if (TRUE %in% Vi.log){
alt.conc.insert<-( (input$voltotal-input$minim)*t$`Concentració Vector (ng)`*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio)/ (input$minim*t$`Longitud Vector (bp)`)
t$`Dilució insert`[Vi.log]<-(t$`Concentració Insert (ng)`/alt.conc.insert)[Vi.log]
alt.conc.insert<-( (input$voltotal-input$minim)*t$`Concentració Vector (ng/ul)`*t$`Longitud Insert (bp)`*input$ratio)/ (input$minim*t$`Longitud Vector (bp)`)
t$`Dilució insert`[Vi.log]<-(t$`Concentració Insert (ng/ul)`/alt.conc.insert)[Vi.log]
t$`Volum insert (ul)`[Vi.log]<-input$minim
t$`Volum vector (ul)`[Vi.log]<-(input$voltotal-input$minim)
}
t["Molècules Vector (fmol)"]<-t$`Volum vector (ul)`*t$`Concentració Vector (ng/ul)`*1000000/(t$`Longitud Vector (bp)`*660*t$`Dilució vector`)
t
}
})

Loading…
Cancel
Save