marcelcosta/BDAccess
1
0
Fork 0
Code Issues 1 Pull Requests Projects Releases Wiki Activity

Commit Graph

  • d3dcbc3d51 Limpieza de código. main marcelcosta 2023-11-22 15:56:39 +01:00
  • faffd13524 Corrección bug al incorporar nuevo PATID en CC. marcelcosta 2023-11-22 15:50:29 +01:00
  • 9f7430a4ae Merge branch 'dev' Costa 2023-10-10 12:59:41 +02:00
  • 4c27e84cbd NHC as a character. marcelcosta 2023-10-10 12:51:15 +02:00
  • 560540cf1a Commit in cytometry. dev marcelcosta 2023-10-10 12:35:43 +02:00
  • bd52e8c452 Corrección nombre de fecha de extracción. Solución de bug. marcelcosta 2023-02-02 16:54:09 +01:00
  • 43b807cc63 Corrección de la función de backup. marcelcosta 2022-07-04 11:09:20 +02:00
  • cb38ea347d Añadir notificación de sincronización y backup de nitrógeno. marcelcosta 2022-07-04 11:08:45 +02:00
  • 6671939939 Cambiar sistema de pedir contraseña. marcelcosta 2022-07-04 10:58:27 +02:00
  • a6f0c97d47 Añadir la opción de pasar la ruta de citometría en texto. marcelcosta 2022-04-20 15:34:54 +02:00
  • 56484a5903 Volver a meter unas línias borradas por error. marcelcosta 2022-04-20 12:13:27 +02:00
  • b5323436ec Boleanas en la app. marcelcosta 2022-04-20 09:49:37 +02:00
  • a57fb3aac8 Gates booleanas se hacen en R y no en Flowjo (que enlentece mucho el análisis). marcelcosta 2022-04-06 16:54:51 +02:00
  • dbb8e1ed0d Merge branch 'dev' marcelcosta 2022-04-06 12:42:53 +02:00
  • e6c2a32ddb Corregir exportar png IC marcelcosta 2022-04-06 12:42:31 +02:00
  • 51acdd0ece Merge branch 'dev' marcelcosta 2022-04-06 12:35:16 +02:00
  • dcbf4f8b9d Canvi en l'ordre de les dependències. marcelcosta 2022-04-06 12:32:41 +02:00
  • 001f64cc76 Merge branch 'dev' marcelcosta 2022-04-06 11:18:24 +02:00
  • e95caafe28 Cambio a pie chart para Visor IC. marcelcosta 2022-04-05 16:57:26 +02:00
  • f45ebfd106 Merge branch 'dev' marcelcosta 2022-04-05 10:09:30 +02:00
  • cb6c739d14 Para actualizar la tabla Poblaciones de citometría, permitir que falten poblaciones (de cara a agrupar diferentes paneles). marcelcosta 2022-04-05 10:08:26 +02:00
  • 20bf1d2c20 He añadido al visor de muestras el plot de IC. marcelcosta 2022-04-04 17:30:55 +02:00
  • a5581182c2 Añadir al visor de muestras el plot de poblaciones. marcelcosta 2022-04-04 17:15:12 +02:00
  • ab1684651e Completado procesado de datos de Checkpoint Inhibitors. marcelcosta 2022-04-04 17:14:42 +02:00
  • 67ba4921ca Añadir sección de citometría para tinciones de Poblaciones. marcelcosta 2022-04-04 15:40:54 +02:00
  • db6c07595c Cambiar etiquetas. marcelcosta 2022-04-04 11:37:56 +02:00
  • 35e4d31495 Iniciar sección citometría. Botón para el directorio. marcelcosta 2022-04-04 11:35:23 +02:00
  • 38aa06c4ee Añadir etiquetas para el código. marcelcosta 2022-04-04 11:34:43 +02:00
  • 38e902cef0 Merge branch 'dev' marcelcosta 2022-04-04 10:53:51 +02:00
  • 3492b7f7ef Corregir año en la fecha de tabla clinics marcelcosta 2022-04-01 12:26:42 +02:00
  • 44901be490 Corregir año en la fecha de tabla clinics marcelcosta 2022-04-01 12:26:04 +02:00
  • 3c8a69b21c Merge branch 'main' into dev marcelcosta 2022-04-01 12:21:02 +02:00
  • 9b8f24ddd8 Corregir formato en las fechas de la plantilla CLINICS. Costa 2022-03-31 14:18:46 +02:00
  • ea45d8c845 merge with nitro Costa 2022-03-31 13:40:47 +02:00
  • 134133498b Corregir carga librerías para merge Costa 2022-03-29 12:24:11 +02:00
  • c9d09c44a2 Cambio de "Sincronizar" a "Actualizar" nitrógeno. Costa 2022-03-28 14:52:42 +02:00
  • b12ae3fd5f Introducción de un botón para actualizar nitrógeno. Costa 2022-03-28 14:52:04 +02:00
  • 2909f49eec Añadido plot para expresión de genes. Costa 2022-03-28 12:49:29 +02:00
  • b14fddf8fe Visor scRNAseq. Costa 2022-03-22 16:29:04 +01:00
  • 5bbd25c64d Empezar visor scRNAseq. Costa 2022-03-22 14:26:33 +01:00
  • 5ea3b493f4 Añadir la sincronización de tablas para CC. Costa 2022-03-22 14:25:17 +01:00
  • ffdf64d736 Añadir cancer de cólon. Costa 2022-03-17 17:15:54 +01:00
  • af5eee3a33 Relleno del visor - fase I Costa 2022-03-17 16:21:24 +01:00
  • 6cdde0282a Creación de una división por paneles. Costa 2022-03-15 11:38:41 +01:00
  • f4c6fae34a Cambio en el formato de definir las rutas. Costa 2022-03-04 17:46:56 +01:00
  • a8ca15592e Corrección de la función de importar NHC de excel. Costa 2022-03-04 17:46:37 +01:00
  • 022a222ddf Soporte para base de datos OVID. Costa 2022-03-04 14:56:19 +01:00
  • 5762efa5e4 Consistencia en sqlGenOVID. Costa 2022-03-03 19:09:29 +01:00
  • df0e5d4985 Añadir espacio Costa 2022-03-02 14:10:39 +01:00
  • b968de1fb1 Añadir aplicación shiny Costa 2022-03-02 14:01:05 +01:00
  • 52f5ad865d Poder cambiar la ruta de la función sqlInitialize. Costa 2022-03-02 14:00:12 +01:00
  • 72f89330e6 Machacar plantilla. Costa 2022-03-01 14:43:47 +01:00
  • 109acff436 Generar tabla vacía cuando no haya CNAG y RNA. Costa 2022-03-01 14:43:25 +01:00
  • 76fa2fc0b1 No machacar la columna Samples de la pestaña NHC de la plantilla. Costa 2022-03-01 14:35:34 +01:00
  • f4f4e6a350 Añadir soporte para asignar CNAG y RNADNA. También para incluir automaticamente la fecha. Costa 2022-03-01 14:26:15 +01:00
  • e948b086ed Quitar un Id. del Carpio Huerta 2022-03-01 13:03:42 +01:00
  • ea01f18d16 Solucionar problemas en la modificación y entrada de nuevos elementos de la tabla CLINICOS. del Carpio Huerta 2022-02-28 16:06:49 +01:00
  • 1be48b44fb Mejorar el escriturado de la pestaña nhc de la plantilla. del Carpio Huerta 2022-02-28 16:06:22 +01:00
  • 766fe1f4d4 Error en la función de llenar la plantilla. del Carpio Huerta 2022-02-28 16:05:48 +01:00
  • 34b54230cb Solucionar otro problema de duplicado. del Carpio Huerta 2022-02-28 16:05:06 +01:00
  • 2e4f3416e6 Solucionar error cuando el NHC está duplicado. del Carpio Huerta 2022-02-28 16:04:36 +01:00
  • 1613207bf6 Corregir función sqlBackup. Costa 2022-01-27 15:04:13 +01:00
  • 4ba729e6c6 Correction of conflicts for merging UM to main. Costa 2022-01-24 15:24:59 +01:00
  • f2f8f12855 Correct workflow to merge. Costa 2022-01-24 15:20:56 +01:00
  • 3b8a4c0657 Correcting some workflow positions. Changing sqlDropLast to sqlLastDrop to avoid errors with sqlDrop. Costa 2022-01-24 14:58:07 +01:00
  • 8c8065fe9d Corregido el error en el que no había pacientes nuevos en la función sqlGenOVID. Costa 2021-12-20 16:17:37 +01:00
  • 944b5df181 Updating documentation. Costa 2021-12-20 16:08:10 +01:00
  • a87460b6bb Completar compatibilidad con MU. Costa 2021-12-20 15:20:11 +01:00
  • d9e8117b83 Cambio de orden en funciones inciales Marin Jimenez 2021-11-17 16:04:43 +01:00
  • 39c9f9bcc4 He puesto el sqlInitizalize antes del sqlBackup. Costa 2021-11-17 15:21:48 +01:00
  • d863315655 He creado la función sqlMultiSamples. También he adaptado la función sqlGenOVID para que sea usable para UM. Costa 2021-11-17 15:20:44 +01:00
  • 126b8c4ee2 Optimización de sqlShowSamples. Costa 2021-11-16 12:37:40 +01:00
  • e185a1e44d Adding dbtype to sqlShowSamples function. Costa 2021-11-16 11:10:11 +01:00
  • ec3a8328e7 Adding dbtype in functions. Costa 2021-11-15 17:42:40 +01:00
  • 3f927a5364 Start changes to both OV and UM. Costa 2021-11-15 17:40:00 +01:00
  • 80dc3ec3d7 Merge branch 'main' of https://git.ratg.cat/marcelcosta/BDAccess Marin Jimenez 2021-11-15 14:19:51 +01:00
  • 24cd858bcd Añadir lectura de NHCs. Solución error en sincronización de SAMPLES por la fecha de columna nueva. Marin Jimenez 2021-11-15 14:19:17 +01:00
  • cdf9eef87d Update 'Docs/Readme.md' marcelcosta 2021-10-29 17:16:30 +02:00
  • 674174c033 Update 'Docs/Readme.md' marcelcosta 2021-10-29 17:03:31 +02:00
  • d8c3a89434 Add 'Docs/Docs.md' marcelcosta 2021-10-29 17:02:56 +02:00
  • d1f684a4f3 Añadida función para crear una copia de seguridad de la base de datos. Costa 2021-10-29 15:01:45 +02:00
  • 29d0fefe69 Add the documentation for the rest of the functions in "sqlFunctions.R". Costa 2021-10-29 12:24:52 +02:00
  • efba0bc64b Añadido mensaje de información. Costa 2021-10-29 12:04:05 +02:00
  • ae68857d49 Añadido función sqlInitialize y TOC a la documentación. Costa 2021-10-28 17:41:43 +02:00
  • 05962b66eb Generación de funciones a partir del script y creación de un ejemplo en "workflow.R". Costa 2021-10-28 17:30:11 +02:00
  • 8b9b9b9681 Corrección update y definir fechas. Marin Jimenez 2021-10-25 17:21:21 +02:00
  • 473eee46ca Corrección ficheros clinics. Marin Jimenez 2021-10-25 16:44:25 +02:00
  • 722399997a Merge branch 'main' of https://git.ratg.cat/marcelcosta/BDAccess Marin Jimenez 2021-10-25 16:42:30 +02:00
  • de5459e8d2 Corrección entrada samples Marin Jimenez 2021-10-25 16:41:53 +02:00
  • bb09abb995 Añadidos subida de datos clínicos modificados y nuevos. Costa 2021-10-25 16:38:33 +02:00
  • e09e2c6344 Separar ruta de la base de datos de script principal. Costa 2021-10-21 09:36:47 +02:00
  • fec8a19df9 Añadir source a las funciones sql. Marin Jimenez 2021-10-19 14:19:56 +02:00
  • 22fa904249 Añadir cabecera descripción. Marin Jimenez 2021-10-19 14:14:34 +02:00
  • 2e04933f2a Creación sqlFunctions y de los ficheros de la documentación. Costa 2021-10-19 12:19:29 +02:00
  • 899daa7e6c Añadido señales de alerta cuando se modifique la base de datos. Costa 2021-10-18 16:18:49 +02:00
  • 29e6ff8479 Añadir comentarios informativos del script. Costa 2021-10-18 15:25:26 +02:00
  • 260737bb1c Subir script i fichero para introducir queries. Costa 2021-10-18 15:06:41 +02:00
  • 535e916d42 Initial commit marcelcosta 2021-10-18 15:02:47 +02:00